重庆市中医药研究院主要承担国家、省部级中药科研项目和企业委托科技项目。中药院内设有中药生药、中药种植、中药化学、中药药理毒理、中药制剂、应用开发、实验动物、冬虫夏草研究等11个业务部门以及办公室、人事、科研、财务等9个行政后勤部门。 中药院内设有中药生药、中药种植、中药化学、中药药理毒理、中药制剂、应用开发、实验动物、冬虫夏草研究等11个业务部门以及办公室、人事、科研、财务等9个行政后勤部门。中药院党委下设党支部16个，院党委委员5人、党员163人。其中，在职党员101人。此外，有农工、九三、民盟和民革等4个民主党派。工会、共青团和女职工组织健全。为全面提升实验室的检测能力，现决定推行CNAS实验室认可。通过综合评定最终选择了深圳市臻达管理顾问有限公司为其提供实验室认可咨询。